Sementara jadwal keberangkatan dan kedatangan KA Manahan di sejumlah stasiun wilayah Daop 5 Purwokerto sesuai Gapeka 2023 yakni:
1. KA Manahan (KA 79F) relasi Solo Balapan – Gambir:
- Datang di Stasiun Kutoarjo pukul 11.28 WIB, berangkat pukul 11.33 WIB.
- Datang di Stasiun Kroya pukul 12.26 WIB, berangkat pukul 12.28 WIB.
- Datang di Stasiun Purwokerto pukul 12.51 WIB, berangkat pukul 12.56 WIB.
2. KA Manahan (KA 81F) relasi Solo Balapan – Gambir:
- Datang di Stasiun Kutoarjo pukul 00.17 WIB, berangkat pukul 00.22 WIB.
- Datang di Stasiun Kebumen pukul 00.43 WIB, berangkat pukul 00.45 WIB.
- Datang di Stasiun Kroya pukul 01.20 WIB, berangkat pukul 01.22 WIB.