- KA 680 berangkat Stasiun Yogyakarta 13.05 WIB tiba di Stasiun Palur 14.40 WIB
- KA 674 berangkat Stasiun Yogyakarta 15.20 WIB tiba di Stasiun Palur 16.41 WIB
- KA 682 berangkat Stasiun Yogyakarta 16.30 WIB tiba di Stasiun Palur 17.52 WIB
- KA 668 berangkat Stasiun Yogyakarta 17.45 WIB tiba di Stasiun Palur 19.07 WIB
- KA 684 berangkat Stasiun Yogyakarta 20.16 WIB tiba di Stasiun Palur 21.38 WIB
- KA690A berangkat Stasiun Yogyakarta 22.35 WIB tiba di Stasiun Palur 00.01 WIB.
Sementara jadwal terbaru KRL Commuter Line relasi Palur - Yogyakarta untuk mendukung perjalanan musim libur sekolah periode 19 Juni - 14 Juli 2023 yaitu:
- KA 661 berangkat Stasiun Palur 04.55 WIB tiba di Stasiun Yogyakarta 06.15 WIB
- KA 669 berangkat Stasiun Palur 06.00 WIB tiba di Stasiun Yogyakarta 07.23 WIB
- KA 677 berangkat Stasiun Palur 07.15 WIB tiba di Stasiun Yogyakarta 08.39 WIB